在中华传统文化与现代学术交融的领域中，马三元以其独特的身份和深邃的见解备受瞩目。他身兼数职，在中国社会科学院中国宗教学会易道专业委员会担任常务理事，同时还是张良书院首创院长、中国蓬莱周易研究会副会长、中国易学文化研究院泰山分院院长。作为天台道医第69代入世弟子、张良祖师爷的第75代徒孙，马三元肩负着传承文化的重任，更是阴盘奇门遁甲的传承人，在数字易经、奇门遁甲（八字奇门、山向奇门、法术奇门、奇门通玄、造生基等）等领域有着深厚的造诣。
突破传统认知：马三元的宇宙物理机械模型
在当下，无论是现代自然科学，还是佛学，都对宇宙有了全新的认知，不再局限于笛卡尔坐标所反映的三维空间，而是认为宇宙是多维的。马三元深入探索这一复杂的宇宙，以独特视角构建了宇宙的物理机械模型，帮助我们更好地理解宇宙的奥秘。
一、构建宇宙物理模型
马三元指出，人与天、宇宙、宇宙多层次的时间以及多层次的生命现象都相互呼应。其中，心心相应尤为关键，在虚空中心存在一个巨大的生命能量团，被称作宙心。从宙心O点向外辐射的射线是宇径，也就是宇宙的半径。在宇径上的B点，以OB为半径扫描出一个球形面，这个球面上各个点的时间速率和光的速度都相同，均为光速30万km/s ，我们暂且称它为“亡灵球面”。宇径OC所扫的球面被称为 “死亡球面”，宇径OD扫描过的立体球面则是“黑谷球面”。
在宇径OD上，各点以及各点所代表的球面，光的速度与时间的速度并不相同。D球面的时速中，光的速度为无限大，而宙心O点的时速，光的速度为无限小，即0。从速度大小来看，D点的光速大于C点的光速大于B点的光速大于A点的光速，B点球面就是爱因斯坦提出的标准光速球面。人类居住在地球上，处于B点，B点的半径≥1000个千秒差距，一个千秒差距等于3260光年。银河系处于B点，半径约为20个千秒差距，太阳系隶属于银河系，距银河系中心点8个千秒差距。即便人类运用最先进的科学技术，在地球上可感知的空间最大半径约为150 - 200个千秒差距，这仅仅是宇宙中的一个小点B，而且只是B点的千分之八即0.8%。若宇宙是旋转的，宇径OD上各点的线速度不同，但角速度相同。宇宙如此浩瀚，难以用言语描述，这个机械模型只是为了便于大众理解而构建的框架结构。
二、解析各界众生及时间差
不同等级的众生居住在不同的宇宙空间。宙心是众生最高级的存在，在佛门被称为佛位。宙心之外，A点是西方极乐世界以及29 - 33 层天；B点内是天人、人、阿修罗（魔）、动物、鬼所在区域；B点以外到C点，C点是地狱。
宙心的时间速度是0，宙心边缘的一秒钟相当于B点时间的2240 万年，而B点的1秒钟，又相当于D点的2240万年。因为宙心时间速度为0，所以在时间上呈现出无始无终、如如不动的状态，佛经称之为无量寿。
宇宙中的一切生命都起源于宙心，从宙心向十方有1000条由生命光子流组成的生命天河，生命天河终止在A点所在的球面上。在A 点球面和B点球面之间是生命的光的海洋。生命光子流很难进入B点球面，B点球面就像是宙心生命体外流的屏障，生命光音能量体要进入B点，必须克服这个时间屏障，进而衰减大量的能量。C点球面是宇宙生命外流的第二层屏障，进入C点的生灵能量很低，基本上属于死灵体。C点球面以外的D球面属于无灵区，无灵区是封闭宇宙生命能量的最后一道屏障。D点球面是宇宙的边界，D点以外是无边无际的黑洞。D点球面就如同宇宙的皮甲，保护着宇宙中的生命。
三、阐释宇宙的成住坏空
宇宙并非一成不变，而是按照一定规律膨胀和收缩。膨胀时发出的基本音流是 “唵……” ，膨胀到极点并停顿的音流是 “啊……” ，收缩时的音流是 “吽…” ，在“吽”音流与下一个“唵”音流之间有一段无音流。宇宙有规律的起伏被称为脉动，每80个脉动有一个较大的脉动，称为脉冲。宙心一个脉动的时间相当于地球上的1600万个太阳年，在佛经中被称为一小劫，20个脉动称为一中劫，即3亿2千万年。一个脉冲周期为一大劫，即12亿8千万年。
在宙心的一次脉冲时，B防护层屏障球形面上出现了一个漏点B。一个巨大能量闯入B区后立即发生光爆，B点上的光爆持续了3亿2 千万年，这个巨大能量几乎丧失全部。光爆在B球面上形成一个小气泡，这就是B点的形成，佛经称此为坏中劫期。巨能团能量耗尽，光爆停止，气泡内充满了由光音色能量经光爆产生的气，这段静止时间经历了3亿2千万年，佛经称为空中劫期。气状物开始凝聚，形成物质性的尘点群，也就是银河系及其它星系，太阳、地球、月亮就在其中。一些生命光子及某些巨型能量团纷纷从漏点渗入B点，附着于星球上就地取材，造业和合成有形体的生命，这期间被称为成中劫期，也是3亿2千万年。有形体生命出现在地球上，生命光音能量团终于和合成较为理想的生命载体——人，这段时间被称为住中劫期，住中劫期时间同样是3亿2千万年。此后宇宙又是下一个脉冲，B点又将进入坏冲劫期。如今距离下一个宙心脉冲的时间，也就是到坏中劫期的时间有831万年，即B点发生光爆、星球毁灭，最终会发生在831 万年之后。
在坏中劫期，B点内一切生命光子，一切生命光音色能量团，均丧尽能量而沉入C点。光爆期后，B点内是死一样寂静的空中劫期。当进入成中劫期后，新的星系又开始形成，一批新的生命光音色能量团及大量生命光子又会从漏点渗入，从而B点内又开始热闹起来，地球生命又形成了，如此循环往复。
四、揭示因果规律
宇宙的基本特征包含三元，即宇、宙、宙心。宇代表多层次的宇宙空间，宙代表多层次的宇宙时间，宙心则是宇宙的生命，即巨大的光音色能量团。整个宇宙飘浮在无边际的黑洞里，宛如一个细胞，宇是细胞体，宙是细胞的生命钟，宙心是细胞的生命。宇宙的时间—— 宙，不仅无始无终，而且永远不会消失。在B球面运行的宙，即宙B，永远在B球面上运行不止。对于静点B来说，宙B在不断地通过，新的宙B也在不断地进入。人类站在B点内，会感觉一批宇B消失了，未来的宙B尚未到来，但实际上走的宙B并未消失，未来的宙B也早已存在。这就是宙心时间的基本特征，无始无终，永不消失。也正是因为宙的这种特征，具有天眼的人可以沿时间即宙B向下游追踪，看见过去的映象，那是宙B经过时带走的印记；也可以向上游追溯到未来的时间，看到将要发生的事，那是过去和现在的行为在未来事上的映印。佛门将这种关系称为因果规律。正是由于因果关系及时间永恒的两个特征存在，才产生了命运学，成为周易八卦、预测学、星象学的基石。B点世界的形成以及地球生命的产生，开启了盘古开天地后的人类文明，才有了如今现代的盛世地球家园。
马三元的理论和传承，不仅为易学研究开辟了新的方向，也为我们理解宇宙和生命提供了独特的视角，在文化传承与科学探索的道路上，留下了浓墨重彩的一笔，值得我们深入研究与探讨。
